长江水产研究所鱼类病害研究室是随着长江所的建立而诞生的，已有五十多年的历史。在过去的几十年中，经过几代鱼病科研工作者的努力，特别是近年在“国家动物疫病防控体系”―“长江流域水生动物疫病重点实验室” 建设项目的支持下，投资1000余万元，购置了包括HITACHI H-7650透射电子显微镜等在内的仪器设备40多台套，实验室面积约1000平方米，初步建成了开展水生动物细胞培养、病原生物分离鉴定、疫病诊断、新技术疫苗研制、抗病毒药物筛选等研究的高水平科研平台。

    几十年来，鱼类病害研究实验室承担了包括国家973、863计划、国家科技攻关（支撑）计划、农业部行业科研专项、国家现代农业产业技术体系岗位科学家等在内的各类科研项目四十余项，均出色地完成了任务。近二十年来，鱼类病害研究实验室在草鱼出血病、鲤鱼病毒病、鲢出血性败血症、斑点叉尾鮰病害、大鲵病害、鲟鱼病害、中华鳖病害以及小龙虾白斑综合征等的流行病学、疫病诊断、病原检测、药物防控、疫苗制备与免疫等方面取得了引人瞩目的成绩。1990年，“草鱼出血病细胞培养灭活疫苗研究”获得水科院科技进步一等奖；1991年，“草鱼出血病防治技术研究”获农业部科技进步一等奖，1993年获国家科技进步一等奖；2002年，“草鱼细胞培养灭活疫苗大规模生产工艺研究”获湖北省科技进步三等奖；2005年，“中华鳖主要传染性疾病防治技术研究”获湖北省科技进步二等奖；2012年，“斑点叉尾鮰肾脏组织细胞系建立与呼肠孤病毒分离鉴定” 获中国水产科学研究院科技进步二等奖、湖北省科技进步三等奖；2015年，“大鲵主要病害病原学与防治技术”获中国水产科学研究院科技进步二等奖；二十余年来，鱼类病害研究室的科研人员在国内外学术期刊上发表研究论文200多篇，主编或参与编写专著10余本。近年，鱼类病害研究室在草鱼出血病口服疫苗研制、草鱼定向抗病毒育种技术、大鲵虹彩病毒分离鉴定与疫苗制备、斑点叉尾鮰出血病呼肠孤病毒分离鉴定、鲤鱼病毒病诊断与病原检测技术等方面取得显著成绩，逐步形成了以鱼类细胞培养、细胞资源收集保藏以及水生动物病毒病原分离培养检测鉴定为特色的学科发展方向。此外，鱼类病害研究室还结合生产实际开展了大量的技术培训、专题讲座与应急技术服务工作，取得显著的社会效益。

    鱼类病害研究室的宗旨是：立足实验室，系统研究鱼类病害发生与流行的基础理论与应用基础理论问题；面向生产实际，着力研发鱼病防控应用技术，解决水产养殖病害防控中的关键性科学技术问题。

    鱼类病害研究室的任务是：积极承担国家水产养殖重大病害防治技术研究项目，争取广泛的横向联系与合作研究课题，开展密切的国内外科研合作与学术交流，针对严重制约我国水产养殖业发展的鱼类重大病害问题，深入系统地开展鱼类病害基础理论、应用基础理论与应用技术的研究，力争在鱼类疾病发生机理与流行规律、疫病诊断与病原检测技术、新技术疫苗研制与免疫预防技术、抗病毒药物筛选与安全用药技术等方面取得突破，同时，紧密结合我国的水产养殖业生产实际，把鱼类病害防控技术研究的科研成果迅速转化为生产力，促进鱼病防控技术水平的提高，推动我国水产养殖业的健康可持续性发展。