机构设置

• 管理部门

  办公室 党委办公室 人事处（博士后科研工作站） 科技处（成果转化处） 财务处 条件处

• 科研部门

  淡水鱼类种质资源与生物技术研究室 渔业资源与环境研究室 水产养殖与遗传育种研究室 鱼类病害研究室 水产营养与饲料研究室 水产品检测与质量安全研究室 水产信息与标准研究室

• 支撑部门

  荆州基地 西南渔业研究中心 梁子湖基地 长江中上游渔业生态保护研究中心

• 挂靠机构

  农业农村部淡水生物多样性保护重点实验室 农业农村部淡水鱼类种质检验测试中心 农业农村部长江中上游渔业资源环境科学观测实验站 农业农村部水产品质量安全风险评估实验室（武汉） 中国水产学会《淡水渔业》杂志社 全国水产标准化技术委员会淡水养殖分技委秘书处 农业农村部长江中上游渔业生态环境监测中心 农业农村部中华鲟保育和增殖放流中心 中国水产科学研究院淡水鱼类育种与健康养殖重点实验室 湖北省水产品质量安全工程技术研究中心 国家斑点叉尾鮰加工技术研发分中心（武汉） 国家农业科学重庆观测实验站